FİLOGENETİK ANALİZ
* Sonuç Süresi: 30-45 gün
* Platform: 8-capillary 3500 Genetic Analyzer
Filogenetik analiz, organizmalar arasındaki evrimsel ilişkileri anlamak için DNA dizilimlerini karşılaştıran güçlü bir yöntemdir. Sanger sekanslama, yüksek doğruluk oranıyla genetik benzerlikleri ve farklılıkları belirlemede önemli bir araçtır.
Avantajları:
*Yüksek doğruluk ve düşük hata oranı
*Evrimsel ilişkilerin güvenilir şekilde belirlenmesi
*Spesifik gen bölgeleri için detaylı analiz
Nasıl Çalışılır?
*DNA izolasyonu ve hedef gen bölgesinin PCR ile çoğaltılması
*Sanger sekanslama yöntemiyle dizileme
*Dizi verilerinin biyoinformatik analizlerle işlenmesi
*Maksimum olasılık, komşu-ilişki veya maksimum tutumluluk gibi yöntemlerle filogenetik ağacın oluşturulması
TÜR TANIMLAMA
* Sonuç Süresi: 30-45 gün
* Platform: 8-capillary 3500 Genetic Analyzer
Mikroorganizmalar, bitkiler, hayvanlar veya diğer canlıların genetik olarak tanımlanması, taksonomik sınıflandırmada kritik bir adımdır. Sanger sekanslama, türlerin genetik belirteçlerini analiz ederek doğru ve güvenilir bir tanımlama sunar.
Avantajları:
*Doğrulanmış referans veritabanlarıyla hassas tür tayini
*Tek gen bölgesi bazlı analizlerle hızlı sonuçlar
*Çevresel örneklerden veya kültürden elde edilen DNA ile çalışma imkânı
Nasıl Çalışılır?
*DNA ekstraksiyonu ve belirli gen bölgelerinin (16S rRNA, COI, ITS vb.) PCR ile çoğaltılması
*Sanger sekanslama ile baz dizisinin belirlenmesi
*Verilerin GenBank, BOLD veya diğer biyoinformatik veritabanlarıyla karşılaştırılması
*Türün belirlenmesi ve taksonomik sınıflandırmanın yapılması
SEKANS ANALİZİ
* Sonuç Süresi: 30-45 gün
* Platform: 8-capillary 3500 Genetic Analyzer
Sanger sekanslama, belirli bir gen bölgesinin dizisinin okunması ve analiz edilmesi için kullanılan en güvenilir yöntemlerden biridir. Mutasyon analizi, polimorfizm tespiti ve genetik varyasyonların incelenmesinde sıklıkla kullanılır.
Avantajları:
*Tek baz seviyesinde yüksek doğrulukta okuma
*SNP (Tek Nükleotid Polimorfizmi) ve mutasyon tespiti
*Klinik, genetik ve araştırma amaçlı kullanılabilirlik
Nasıl Çalışılır?
*DNA’nın ekstraksiyonu ve hedef gen bölgesinin çoğaltılması
*Dideoksi yöntemine dayalı Sanger sekanslama uygulanması
*Otomatik sekans analiz cihazında okunması
*Veri analizinin yapılması, mutasyon veya polimorfizmin değerlendirilmesi
